此次系列培训班主题内容为生信入门基础课程、比较基因组学生信课程、单细胞生信分析课程,主要面向零基础的、有数据分析及绘图展示需求的学员。本期培训班共有70名来自全国各地的老师参加。在为期3天的课程中,学员们在讲课老师的带领下系统的学习了生信入门基础知识、比较基因组学、单细胞生信分析等生信分析课程。
同时,在学习的过程中,我们的授课老师和助教现场为大家解答在实际操作中遇到的技术问题。
老师在现场指导学员操作
由于许多学员都是零基础学习,在课后复习时还是会碰到许多难以解决的问题。我们在课下会以QQ交流群的形式与学员进行交流探讨,提供指导,保障学员培训后的自我学习,从而更高效的完成学习目标。
本届微生物学会设有1个主会场以及10个分会场,包括“微生物–矿物相互作用及共演化”,“元素生物地球化学循环与全球变化”,“地质微生物与能源转化”,“地质环境微生物与环境修复”,“大气微生物与环境效应”,“微生物与土壤健康”等10个热点主题,由14位重量级前沿科研工作者及其课题组优秀青年学者共同奉献了超过130余场学术报告,其中大多主题利用了高通量测序工具克服了目前的研究瓶颈,极大提高了科研效率,吸引力500余位优秀科研人员共同参与讨论。
展会期间百迈客发扬以科研为中心的优秀企业精神,全程设立展位,展示了全方位微生物组研究相关组学产品,包括前沿组学工具?绝对定量微生物组学测序,高数据量全长多样性研究,?长度长宏基因组学,以及全方位探讨生物学问题的?动植物-微生物互作多组学联合分析应用产品,与前来参会的研究学者热烈讨论了地质微生物组学现有研究问题与发展前景,吸引了大量优秀学者驻留探讨。展位现场火爆,大家对不同的产品提出了不同的问题,现场的工作人员都做了详细的解答和交流。
后续百迈客将继续关注多组学前沿研究,本着服务于科研的目的,为广大科研工作者提供更多优质的产品和服务,从技术方法层面,推动交叉学科领域的科学研究。
]]>第十届全国功能基因组学高峰论坛是中国基因产业具有影响力的行业峰会之一,为展示我国功能基因组学在多组学和大数据背景下的重大研究进展,促进功能基因组学各研究领域的交流与合作,加强行业信息与资源的共享以及成果转化,在高通量测序技术、多组学分析方法及生物云蓬勃发展的背景下,本届大会将邀请各界领域领军者共同探索功能基因组学的新技术和新思路,以及大数据时代下的功能基因组学发展方向与未来!
会议时间:2023年10月23日~10月27日
22日报道,23日主会场,24日五个分会场(植物功能基因组学研究会场、动物多组学应用研究会场、微生物质谱多组学研究会场、医学多组学精准诊疗应用研究会场、时空多组学技术发展及应用会场)并行,25-27日为期刊讲座及培训课程。
会议地点:山东省·青岛市金沙滩希尔顿酒店
会议注册费:2500元/人
植物功能基因组学研究会场主题会场
随着基因组组装(GA)、种质资源鉴定(GC)、基因功能鉴定(GI)、基因组育种(GB)、基因编辑(GE)的5G育种策略快速发展,以高通量测序技术为基础的组学研究已经广泛应用于植物研究的各个领域。本会场特邀植物功能基因组学、系统与进化植物学、表观遗传学等热点领域专家齐聚一堂,分享植物研究的前沿技术、经验成果及发展前景。
动物多组学应用研究会场
随着高通量测序技术和生物信息科学技术的蓬勃发展,生物大数据已然成为了二十一世纪有活跃力的技术领域。完整基因组构建、动态三维调控、功能基因定位、转录、蛋白&代谢、微生物等多组学技术,在动物功能研究上日臻成熟。为了展示和交流动物多组学领域的新成果、新进展,共同探讨动物领域的热点、难点问题,本会场特邀动物领域专家学者,围绕动物起源进化及遗传多样性、动物育种及生长发育、重要功能性状遗传机制、动物营养与肉质品质、动物环境适应机制、动物致病机理等研究主题,分享研究进展及经验成果。
微生物质谱多组学研究会场
随着测序技术、高分辨质谱技术和多组学整合分析方法及数据库的发展,微生物组学研究正在从单一组学向多组学(微生物联合代谢/转录/蛋白等)技术发展。以多组学驱动的微生物组学研究将带来生命科学研究的新范式。微生物多组学现已广泛应用于微生物资源与微生物组、病原微生物与健康、环境微生物与环境生物技术等领域。本会场特邀微生物组领域专家学者,围绕微生物资源、微生物与人体健康、环境微生物等主题,共同分享微生物多组学研究进展和研究成果。
医学多组学精准诊疗应用研究会场
随着基因组测序技术的快速发展以及生物信息与大数据科学的交互应用,精准诊疗从理论照进了现实。同时转录组学、蛋白组学和代谢组学等组学模式搭载单细胞和空间测序技术的东风进入单细胞/空间时代。人类对肿瘤的分子机制、疾病的发生机理及生命的发育进程等方向能够进行更精细的解析,并借此实现在个体的分子和细胞而非症状水平上制定适合自身的诊断、治疗及预防。本会场特邀医学领域专家齐聚一堂,共同探讨医学研究前沿进展及经验分享。
时空多组学技术发展及应用会场
收款单位及开户名:北京百迈客生物科技有限公司
开户行及账号::中国工商银行股份有限公司北京顺义支行0200005909200203276
请务必附言:峰会报名+缴费姓名如多人同时缴费,请注明所有参会人姓名;请采用银行汇款方式缴纳注册费。
支付宝账号:972014944@qq.com
如果您对我们的服务感兴趣,欢迎点击下方按钮联系我们
]]>2022 CBIC第四届细胞生物产业大会、第二届中国生物医药创新合作大会于2022年7月28-29日在北京隆重举行。青岛百创智能制造技术有限公司(百创智造)受邀参会。百创智造刘敏副总裁以“把薪助火 || 百万级单细胞、亚细胞级分辨率空间转录组”进行了主题演讲,分别以单细胞测序助力靶药研究、单细胞eQTL助力疾病医疗、时空组学指导临床用药等视角与众多参会代表分享、探讨了时空组学在精准医疗领域的研究进展与未来展望。
图1 刘敏副总裁发表主题演讲
图2 刘敏副总裁和参会代表分享单细胞在医疗领域的研究进展
同时,刘敏副总裁也分享了百创智造助力时空组学向临床医疗迈进的亚细胞级空间转录组芯片-百创S1000和单细胞微液滴平台-百创DG1000。通过与来自全国各地参会代表的沟通和交流,参会代表对我们百创S1000可调节的亚细胞分辨率芯片和百创DG1000极快的单细胞微液滴系统产生了浓厚的兴趣,并希望能够进一步探讨和合作。
会议期间,到访我们展台的代表络绎不绝。通过本次会议,我们也对国内细胞生物研究在精准医学的发展有了新的理解,对单细胞多组学在临床应用有了更加明确的方向。这些也为我们日后的相关工作提出了指导意见。
图3 参会代表了解百创S1000和百创DG1000
为了突破单细胞试剂耗材及仪器长期以来的国外技术垄断,降低单细胞应用的成本,让单细胞技术能够惠及更多的科研群体,经过多年潜心研发,百创智造发布自主研发的极速单细胞微液滴系统-百创DG1000。百创DG1000是基于微流控、油滴包裹和Barcode标记等技术来实现高通量的细胞捕获。除了仪器以外,百创DG1000还有配套的2×4的独立芯片及配套试剂盒(图4)。
图4百创DG1000
百创DG1000技术特点:
PBMC重复性检测:将相同的PBMC细胞悬液分3份,通过3个不同实验人员,用3台百创DG1000仪器,独立进行单细胞测序,得到了几乎一致的细胞聚类分群结果,证明百创DG1000具有很好的可重复性及稳定性(图5)。
图5 PBMC重复性测试数据
为了打破空间测序市场被国外公司长期占据,以及改变主流商业化平台的分辨率较低的的局面,经过多年的潜心研发,百创智造发布了基于微孔微珠的亚细胞级分辨率的空间转录芯片及配套试剂-百创S1000。该技术直接将空间组学分辨率从100μm(主流技术平台)提高到~5μm的亚细胞水平,标志着全面迈入国产化的空间转录组亚细胞技术时代的到来(图6)。
图6 百创S1000
百创S1000技术特点:
大鼠胚胎亚细胞分辨率实测数据展示:与100μm分辨率(主流技术平台)对比,高分辨率(~50μm)下HE染色组织形态学与spots聚类空间分布图重合度更高,精准识别空间基因表达的异质性和组织区域的特异性(图7)。
图7:百创S1000胚胎亚细胞分辨率空间转录组检测结果
扫码观看CBIC北京细胞生物医药产业大会报告视频回放
如果您对我们的平台感兴趣,欢迎点击下方联系我们。
]]>
该报道内容于2022年7月17日在北京电视台财经频道《北京直通车》栏目播出,让我们一起来了解百迈客生物如何以科技创新为基石,助力科学家永攀科研高峰。
图为北京电视台财经频道编导田聪在发布会现场与嘉宾对话
近年来,空间转录组的研究逐渐受到广大研究学者的青睐,这对于癌症发病机制、神经科学、发育生物学等众多领域的研究都有着重要意义。
中国科学院院士陈润生说道:“空间转录组我们知道是整个多组学发展的一个更前沿的阶段。我们从上世纪90年代开始测序了人的遗传密码以后,大家知道对于整个生物医学很多基本问题的推进迈出了划时代的一步,就使得这些问题的解决到了分子水平。所以这样看来,无论从基础研究还是对临床研究来讲,当前的这个空间转录组学都是当前大数据多组学研究一个新的进展,因此它具有非常重要且深远的意义。”
陈润生院士受北京电视台专访
近日,以精芯智造?探索生命为主题的“亚细胞级微孔空间转录组芯片”发布会在京举办。百迈客生物经过多年研发,正式发布了亚细胞级微孔空间转录组芯片:百创S1000。本次发布的百创S1000的突破就是将空间分辨率提升至5微米,而传统的主流空间芯片制造还处于100微米的分辨率。
百创S1000空间转录组芯片
百迈客生物总裁郑洪坤介绍:我们今天发布的百创S1000空间组学的产品,一个创新点还是解决了之前我们用户对于做这种细胞水平的基因分析和基因检测分辨率太低的问题,直接给它做到了一个亚细胞的水平。
百迈客生物总裁郑洪坤受邀专访中
中国科学院院士陈润生表示:今天发布的百创S1000实际上大家知道从技术上应该说是有很大的提高。百创S1000可以让研究者们结合不同阶段图谱数据,获得全面的亚细胞级时空动态表达图谱,从而为疾病的诊断治疗及药物研发提供更有力的决策依据,相比目前国外空间转录组测序芯片精度提高了近400倍。
百创S1000发布会现场
百迈客生物总裁郑洪坤强调:我们现在公司三大块方向,一块是叫科技服务是做服务,一块是做我们的云平台是一个SaaS(软件服务平台)的产品,一块是智能制造。往下走的重点里面会更多的往智能制造这块,特别是我们创新的东西会倾斜的更多一些。
百迈客生物对于技术创新的研究仍在继续,秉持着生物科技创新服务社会、造福人民的企业使命,企业将持续迈进、探索生命未来。
播出视频如下:
]]>
第九届全国功能基因组学高峰论坛是中国基因产业具有影响力的行业峰会之一,为展示我国功能基因组学在多组学和大数据背景下重大研究进展,促进功能基因组学各研究领域的交流与合作,加强行业信息与资源的共享以及成果转化,在高通量测序技术、多组学分析方法及生物云蓬勃发展的背景下,本届大会将邀请各界领域领军者共同探索功能基因组学的新技术和新思路,以及大数据时代下的功能基因组学发展方向与未来!
时间:2022年10月17日-20日
地点:大会线上直播间
大会官网:http://summit.biomarker.com.cn/
随着基因组组装(GA)、种质资源鉴定(GC)、基因功能鉴定(GI)、基因组育种(GB)、基因编辑(GE)的5G育种策略快速发展,以高通量测序技术为基础的组学研究已经广泛应用于植物研究的各个领域。本次大会特邀植物功能基因组学、系统与进化植物学、表观遗传学等热点领域专家齐聚一堂,分享植物研究的前沿技术、经验成果及发展前景。
生物大数据是21世纪具有创新力活跃的技术领域。完整基因组构建、动态三维调控、功能基因定位、蛋白&代谢等多组学技术,在动物功能研究上日臻成熟。如何利用大数据解析遗传潜能已成为科研学者重点研究方向。为了展示和交流动物遗传学领域的新成果、新进展,共同探讨动物领域的热点、难点问题,本会场特邀动物领域专家学者,围绕动物起源进化及遗传多样性、动物育种及重要功能性状遗传机制解析等主题,分享研究进展及经验成果。
微生物组是当今世界热门的研究领域之一,新发现,新技术层出不穷,高通量测序作为微生物组研究的有力工具,在植物-微生物-相互作用,病原微生物与健康,传染病诊断与防治、微生物生理代谢与合成生物学等领域发挥着重要作用。本会场特邀微生物领域专家齐聚一堂,共同探讨微生物研究前沿进展及经验分享。
疾病的发生发展涉及基因变异、基因表达失调、表观遗传改变、代谢蛋白分子变化等复杂调控网络,搭载Nanopore测序技术,联合基因表达量、染色质三维构象、染色质可及性、代谢物和蛋白质多肽等热点研究方向,可以从多组学维度系统性研究发病机理、确认疾病靶点和发现生物标志物。本会场特邀医学领域专家齐聚一堂,共同探讨医学研究前沿进展及经验分享。
随着单细胞和空间多组学技术的快速发展,开启生命科学时空多维新时代,为复杂疾病的细胞异质性和结构异质性研究提供新视角,百迈客自主研发的百创DG1000单细胞、百创S1000空间测序技术不仅开启了空间转录组亚细胞时代,还极大的降低单细胞&空间组学科学应用的成本和门槛,同时促进了单细胞空间组学在生长发育、疾病机理、免疫调控、肿瘤精准研究等方向的广泛应用。本次论坛特邀请单细胞、空间转录组的科学家和业界技术专家齐聚一堂,共同分享该领域的进展和未来愿景。
注册费:1200元/人
收款单位/开户名:北京百迈客生物科技有限公司
开户行/账号:北京银行航港支行:20000030331300007039078
支付宝账号:972014944@qq.com
打款请附言:峰会+姓名+手机号码
5月份,北京大学现代农业研究院联合百迈客生物针对农作物应用研究方面的前沿技术开展了学术交流。
会上百迈客生物一行针对近期推出的亚细胞级微孔芯片百创S1000,以及国产化单细胞仪器百创DG1000与研究院PI们进行了热烈的讨论,话题主要集中在如何将新的技术能更好的应用到产品研究中,从而提高农业作物的成果转化。同时,北京大学邓兴旺院士及百迈客生物董事长郑洪坤也表示,双方要加强对外交流,利用双方的优势来进一步开拓大家的科研视野,提升青年科研工作者的科研激情,从而带领大家一起为国家的“粮食”做好“后勤工作”。
据悉,北京大学现代农业研究院是北京大学与山东省人民政府合作共建。2021年7月研究院正式搬入山东潍坊新院区,新院区坐落于美丽的峡山风景区旁,占地300亩,目前已建成科研综合楼、接待中心、会议中心、餐饮中心、高级专家公寓、教师公寓、学生公寓等7.1万平米的房屋设施。
研究院致力于从事基础研究-应用研究-成果转化-产业扶持的全链式现代农业科技创新工作。?配备冷冻透射电镜、全套质谱分析系统等价值2亿多元设备及241名高精尖专家学者,?以小麦杂交育种技术为突破口,解决世界第一大主粮的“芯片”问题,为国家的粮食安全提供技术保障。同时,以满足人民美好健康生活为目标,聚焦农业新业态,培育果蔬新品种,解决我国蔬果种子攻坚战中的卡脖子问题。配合“三个模式”的战略发展定位,探索农业科技与乡村振兴互促共生的新模式、新路径,为潍坊乃至山东及全国的农业经济高质量发展提供智库支撑。
未来,北京大学现代研究院与百迈客将会加深双方人才及技术的交流,利用双方高新技术及高精尖专业人才,共同推进中国农业科技的发展,助力中国农业经济高质量发展。
]]>
十三载,日居月诸,时岁枯荣,我们以人为本,客户至上。
十三载,不啻微芒,造炬成阳,我们持续学习,持续创新。
十三载,青衿之志,履践致远,我们目标明确,说到做到。
十三载,一载一成酌,我们拼搏进取,团队协作。
百迈客风雨同济十三载,感恩诸位科研工作者的支持与肯定!“价”与“礼”均为您呈上!
RT-qPCR包括三大步骤:RNA的提取与质量检测、逆转录成cDNA、以及实时荧光定量PCR实验。通过RT-qPCR实验,可以合成cDNA探针、获取目的基因、以及分析基因的转录水平。
从细胞、组织等样本中提取出RNA后,需要对提取的RNA的纯度、浓度、以及完整性进行评估,质检达标后才能进行后续的实验。一般需要通过紫外分光光度法(Nanodrop仪器)检测RNA的浓度和纯度;Agilent 2100仪器分析RIN值检测RNA的完整性;以及琼脂糖凝胶电泳检测RNA是否有基因组污染和其他杂质污染。
1.RNA的浓度&纯度检测(吸光度法)
由于RNA具有共轭结构,可以吸收紫外光,故测定RNA溶液在260 nm的吸光度值,可计算出RNA的含量。其中纯度高的RNA,A260/A280比值应在1.9~2.2之间,若比值>2.2,表明可能有异硫氰酸,若比值<1.9,表明有蛋白质、酚等污染;建议重新提取RNA。
2.RNA完整性检测(Agilent 2100分析)
RIN值大小反映样品的完整性,一般RIN值在5~10之间,数值越接近10表明RNA完整性越高,反之RIN值越小完整性越差(特殊样品需结合基线综合评估)。Agilent 2100检测不仅可以得到样品RIN值,还可以得到样品浓度以及28S/18S比值(原核生物是23S/16S)。
3.基因组及其他杂质污染检测(凝胶电泳)
真核生物RNA特有28S、18S、5S三条带,进行琼脂糖凝胶电泳分析时,28S条带的亮度大概是18S条带的两倍或者以上,且无拖尾,说明RNA的完整性高、未被其他杂质污染。若出现其他条带、或者条带弥散拖尾,建议重新提取RNA。
总之,RNA提取的原则:
① 保证RNA一级结构的完整性;
② 不存在对酶存在抑制作用的有机溶剂,以及过高浓度的金属离子污染;
③ 其他蛋白质、多糖和脂类污染;
④ 排除其他核酸分子(DNA、游离核苷酸等)污染。
cDNA的合成是RT-PCR的重要环节。提取完组织或细胞中的总RNA后,以其中的mRNA作为模板,利用逆转录酶逆转成第一链cDNA,构建cDNA文库,并从中筛选特异的目的基因。该方法已成为基因工程技术中获得目的基因的策略之一。
不同mRNA拷贝成cDNA的效率不同;因此,选择合适的逆转录酶、二价阳离子、dNTP、引物的选择等非常重要。具体参数如下:
1.逆转录酶
目前市场上有两种不同的逆转录酶,一种来自纯化的禽成髓细胞瘤病毒(AMV),由两条肽链组成,具有聚合酶活性和很强的RNA酶H活性,它最适温度是42?℃,最适pH 8.3。但是高水平的RNA酶H的活性既抑制cDNA产生也限制其长度。
另一种来源于鼠白血病病毒(Mo-MLV)的逆转录酶,是单肽链的,有RNA聚合酶活性和相对较弱的RNA酶H活性,最适温度37?℃,最适pH 7.6,较弱的RNA酶H活性,可扩增2-3 kb的cDNA。
2.单价阳离子
3.二价阳离子
4.dNTP
5.引物的选择
注意事项?
1.cDNA第一链合成的反应液需要冰上配制。
2.高纯度、完整性好的RNA对于RT-PCR检测至关重要。
3.Oligo-dT引物对于大多数应用是常用的,因为它确保所有cDNA拷贝终止于mRNA的3′?末端并可获得最高产量的全长cDNA。
荧光定量PCR(Real-time Quantitative PCR)是通过检测DNA双链结合的染料,是 SYBR? Green I对DNA扩增过程中的起始量进行定量监测的技术手段。qPCR实验结果包含扩增曲线和溶解曲线。
注意事项
(1) 请确保引物的正确性和特异性。通常引物终浓度0.2 μM可以得到较好结果。反应性能较差时,可以在0.1~1.0 μM范围内调整引物浓度。
(2) 扩增产物的长度建议选择在70~200 bp范围内。
(3) 梯度稀释模板,并依次建立标准曲线。
(4) 建议20 μL反应体系中加入1 pg~100 ng的DNA为模板,并设计无模板对照(NTC)。
(5)?为确保实验重复性,建议每个样品和对照组设置3个复孔。
相关产品
精彩回顾
DNA&RNA提取-海洋/细胞or肌肉/全血/动物组织 | 一网打尽
微量核酸提取|~5mg动物组织样本,20 min完成DNA&RNA提取
百迈客试剂现货发售,开学礼活动火热进行中,试剂6折起,还能享受满5赠1;
买百迈客试剂用生物信息培训班火热进行中;
买百迈客试剂送全国功能基因组峰会注册名额正在进行中;
活动详情可咨询百迈客驻地销售。
百迈客试剂技术咨询QQ:1608430349。
第八届全国功能基因组学高峰论坛会议官网:http://summit.biomarker.com.cn/
]]>