答：sRNA测序产品可以对动植物、全血、细胞等组织或者核酸样本进行测序，分析要求需要有对应物种的参考基因组，具体的送样指导，请参考如下内容：

答：植物miRNA可与mRNA的编码区完全互补配对，并通过诱导mRNA降解而发挥抑制表达的作用。动物miRNA则可与mRNA的3’UTR区部分互补配对结合，进而抑制翻译的进行，一般的，miRNA与mRNA的配对区域位于miRNA的5’端的 2-8个碱基，称为种子区，只要种子区能与mRNA互补配对即可发挥作用，这也是一个miNRA能够调控数百条mRNA的原因。
我们根据已知miRNA和新预测的miRNA与对应物种的基因序列信息，植物用 TargetFinder软件进行靶基因预测；动物用miRanda和targetscan进行靶基因预测。

答：
RT-PCR对miRNA进行定量验证；
miRNA过表达；
荧光素酶法，过表达miRNA测定靶基因表达量；把靶基因连上一个荧光素酶，如果靶基因表达量下降，可检测到的荧光信号则减弱
降解组测序

答：
参照miRBase的命名规则：{物种名缩写}-miR-{编号};miR-前缀后面所跟着的数字，代表命名的顺序，比如，miR-124比miR-456发现得早。“miR-”代表成熟的miRNA、“mir-”代表pre-miRNA和pri-miRNA、“MIR”代表编码miRNA的基因。
miRNA几乎全是独一的编码顺序，但对于拥有一两个碱基不同的则会被标上字母以示，例如，miR-124a与miR-124b。 若成熟的miRNA相同，但pre-miRNA和pri-miRNA和编码他们的基因来自于不同的基因组，则使用数字来表示，例如，mir-194-1和mir-194-2表示两个pre-， pri-miRNA剪切后的成熟miRNA是完全相同的，但却是两个不同的来源。
前缀的三个字母代表了不同的种族来源，例如，hsa-miR-194代表miRNA来源于人类，oar-miR-124来源于绵羊。
对于形成pre-，pri-miRNA茎环的两端miRNA， 通常一端在数量上远远超过另一端。数量优势的一端往往称为guide strand，而另一端被称为passenger strand，通常被大量降解，用*号来表示，例如miR-124和miR-124*。
最新版中miRBase已经不再使用*来标记microRNA与其发夹前体互补配对位置的互补序列，而是使用“-3p”与“-5p”作为区分这两条序列的后缀替代旧的的命名法。(参考http://www.mirbase.org/help/nomenclature.shtml)
举例： aly-miR158b-3p， aly 代表这是Arabidopsis lyrata 物种的miRNA, -miR158b表示这是成熟的miRNA , 其中b表示还有一个miRNA序列与它相似，仅有一两个碱基不同。 -3p 表示它从前体的3’端剪切得到。
对新预测的miRNA 我们统一用 novel_miR_{数字编号} 来命名， 如 novel_miR_4974。

答：
在已知miRNA鉴定方面，我们将比对到参考基因组的reads与miRBase（v22）数据库中的已知miRNA的成熟序列及其上游2nt与下游5nt的范围进行比对，最多允许一个错配，这样鉴定到的reads被认为是鉴定到的已知miRNA。
miRNA转录起始位点多位于基因间隔区、内含子以及编码序列的反向互补序列上，其前体具有标志性的发夹结构，成熟体的形成是由Dicer/DCL酶的剪切实现的。针对miRNA的生物特征，对于未鉴定到已知miRNA的序列，百迈客利用miRDeep2软件进行新miRNA的预测。
我们利用miRDeep2软件包,通过reads比对到基因组上的位置信息得到可能的前体序列，基于reads在前体序列上的分布信息(基于miRNA产生特点，mature,star,loop)及前体结构能量信息(RNAfold randfold)采用贝叶斯模型经打分最终实现新miRNA的预测。miRDeep2主要用于动物miRNA的预测，通过参数的调整及打分系统的改变也可以对植物的miRNA进行预测。