?百迈客代谢组分析平台于2018年上线,为广大客户群体提供无门槛的代谢组分析服务,自上线以来,收获了大量好评和建议,百迈客代谢组分析平台保持升级和优化,本期代谢组分析平台新增了高频热点分析内容:Kmeans聚类分析、箱线图、小提琴图、雷达图个性化分析以及PCoA、火山图、Z-score和差异代谢物箱线图交互式分析。话不多说,接下来给各位老师介绍本次更新内容,欢迎老师可访问网址http://www.biocloud.net/免费注册体验。①在应用中心中选择-代谢组分析平台
②打开软件
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④等待5min左右即可在我的项目-极速体验项目-代谢组急速体验项目查看
1、k-means聚类分析可将在不同组含量增减趋势相似的代谢物分成若干个聚类,用于研究每个聚类中的代谢物是否具有相似的功能或直/间接的调控关系;
2、主坐标分析可用研究差异分组之间和组内样本之间的变异度大小。PCoA图交互式可实现数据标签的显示,更改散点形状和大小,添加置信椭圆和填充颜色等自定义功能;
3、箱线图和小提琴图可以反映数据的分布情况和变异程度,小提琴图结合了箱式图和密度图的特征,主要用来显示数据的分布性状。箱线图和小提琴图可直观展示组间显著差异的代谢物。
1、雷达图 (Radar Chart) 是用来比较多个定量变量的方法,可用于查看哪些变量具有相似数值,或者每个变量中有没有任何异常值。雷达图可展示出组间显著差异代谢物,一般挑选log2FC绝对值大的前10个代谢物进行雷达图的展示。
2、Z-score分析:Z-score是基于代谢物的定量值转换而来的值,用于衡量实验组相对于对照组的差异偏离情况。通过Z-score图可展示不同两组间差异代谢物的偏离情况。
3、通过火山图(Volcano Plot)可以快速地查看代谢物在两个组中含量的差异总体趋势,以及代谢物差异的统计学显著性。差异表达火山图交互式可实现显示数据标签,更改散点形状,显示代谢物名称/代谢物等自定义功能。
4、百迈客差异代谢物箱线图交互式可实现箱体颜色修改,是否显示数据点,差异性检验P值或*值等自定义功能。
以上就是本期代谢组分析平台更新的所有内容,欢迎各位老师前往体验,百迈客代谢组分析平台也将持续升级,为您提供高效便捷的可视化分析服务。
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